大正期に県下の名門岩尾牧場で乳牛飼育・牧場経営を学んだ一ノ宮村次氏が、帰郷後に結成した「夜明酪農組合」をその前身とする。当初は日華事変で悪化した肥料供給を解決するために、果樹園を営んでいた農家に呼び掛け厩肥確保を目指したものであったようだ。

昭和23年、「生産から消費まで」の理想を掲げ、ついに日田酪農組合へ発展。翌年には市乳販売を開始すると、同30年 福岡市平尾にあった赤坂牛乳を買収・福岡工場と成し、積極的な事業展開を行う酪農協として名を馳せた。

大手乳業の地方進出に対抗すべく、早くも昭和38年には近隣2農協（旧・大分県酪および豊前酪農）と合併、大分県酪農業協同組合として再発足するも、「日田牛乳」銘 それ自体はなお昭和40年代中期に至るまで商われた。

新生・大分県酪は当初より地場大連合による経営力強化を期して結成された背景があり、合併後間もなく乳業各社の資本参加を仰ぎつつ九州乳業（株）を打ち建て、ブランドを「みどり牛乳」に策定、現在に至る。

九州乳業の展開に伴い、日田酪農の拠点ミルクプラントは同社の日田工場、福岡県下の施設は同じく福岡工場としてなお操業が続けられた。

前者は段階的に生産品目を減じつつ最終的には営業所へ転換。福岡工場は昭和40年に早くも移転（筑紫郡春日町）し、旧来の工場は閉鎖となっている。

設立＞ 昭和22年
昭31＞ 日田酪農協組・森山清／大分県日田市大字隈93
昭34〜36＞ 日田酪農協組／同上
昭38＞ 近隣3農協と合併、大分県酪農業協同組合となる
昭39＞ 九州乳業（株）設立に出資統合、同・日田工場となる
昭40〜43＞ 九州乳業日田事業所／同上
昭46＞ 九州乳業（株）日田工場／大分県日田市新治町
※昭和46年、日田工場は乳酸菌飲料専門工場へ転換・以下「乳製品工場」としての掲載
昭50〜60＞ 同上／大分県日田市十二町字花の木511-3
平04＞ 同上／大分県日田市新治町512-4
電話帳掲載＞ 九州乳業（株）日田営業所／大分県日田市大字求来里988-1
銘柄廃止＞ 昭和40年代中期？
公式サイト＞ 大分県酪農協としては未確認

※分工場所在地は割愛

処理業者名と所在地は、全国飲用牛乳協会 [牛乳年鑑1957年版]・食糧タイムス社 [全国乳業年鑑] 各年度版による。創業年等の一部情報は公式サイト他からの引用あり。電話帳掲載の確認は平成19年時点。